商铺办房产证需要缴纳的契税一般按照商铺总价百分之三的比例征收。二套商铺办房产证需要缴纳的契税按照商铺总价百分之四的比例征收。商铺办房产证除了需要缴纳契税外还需要缴纳工本费、印花税、房屋交易费、房产登记手续费、权证印花税。
一、商铺办房产证交多少契税
商铺契税：是指在房产交易活动中商业房产买卖的相关税费。按商铺性质可分为新开发商铺（开发商开发销售的商业房产）买卖税费和二手商铺买卖税费；按税费负担情况可分为买方税费和卖方税费；按税费性质可分为交易税和交易费等。个人购买非普通住宅，二套及以上住房，以及商业投资性房产（商铺、办公写字楼、商业公寓等）均按照4%的税率征收。契税计算方法:新房应纳金额=计税依据x税率;二手房应纳税额=二手房税率X房地产评估价格。
二、办商品房产权证需要哪些材料
在实践中，办理房产证需要提供的材料包括房屋买卖合同、土地使用权证明等。
《中华人民共和国民法典》第二百零九条【不动产物权登记的效力】不动产物权的设立、变更、转让和消灭，经依法登记，发生效力；未经登记，不发生效力，但是法律另有规定的除外。
依法属于国家所有的自然资源，所有权可以不登记。
《不动产登记暂行条例实施细则》第三十五条申请国有建设用地使用权及房屋所有权首次登记的，应当提交下列材料：
（一）不动产权属证书或者土地权属来源材料；
（二）建设工程符合规划的材料；
（三）房屋已经竣工的材料；
（四）房地产调查或者测绘报告；
（五）相关税费缴纳凭证；
（六）其他必要材料。
第三十八条申请国有建设用地使用权及房屋所有权转移登记的，应当根据不同情况，提交下列材料：
（一）不动产权属证书；
（二）买卖、互换、赠与合同；
（三）继承或者受遗赠的材料；
（四）分割、合并协议；
（五）人民法院或者仲裁委员会生效的法律文书；
（六）有批准权的人民政府或者主管部门的批准文件；
（七）相关税费缴纳凭证；
（八）其他必要材料。
不动产买卖合同依法应当备案的，申请人申请登记时须提交经备案的买卖合同。
三、办理商铺房产证需要交纳什么费用
需要交商铺买卖税，商铺买卖税费是指在房产交易活动中商业房产买卖的相关税费。对于购铺者来说，
（一）房地产交易手续费：商铺11元/平方米.
（二）房屋登记费：550元/本（每增加一本证书按每本10元收取工本费）。
（三）权证印花税：5元/本。
（四）印花税：0.05% 5、契税：交易价（或评估价）×4%。
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