处理对伤残鉴定结论的质疑的方式是向鉴定委员会提出再次鉴定申请，需要在收到鉴定结论十五日内提出。伤残鉴定流程为鉴定机构接受鉴定人的委托，作出是否受理的决定等。
一、
如何处理对伤残鉴定结论的质疑
处理对伤残鉴定结论的质疑的方式是可以在收到该鉴定结论之日起15日内向省、自治区、直辖市劳动能力鉴定委员会提出再次鉴定申请。劳动能力鉴定工作应当客观、公正。劳动能力鉴定委员会组成人员或者参加鉴定的专家与当事人有利害关系的，应当回避。
《工伤保险条例》第二十六条 申请鉴定的单位或者个人对设区的市级劳动能力鉴定委员会作出的鉴定结论不服的，可以在收到该鉴定结论之日起15日内向省、自治区、直辖市劳动能力鉴定委员会提出再次鉴定申请。省、自治区、直辖市劳动能力鉴定委员会作出的劳动能力鉴定结论为最终结论。
二、
伤残鉴定流程
找法网提醒您，伤残鉴定流程为：
1.委托，司法鉴定机构和社会专业司法鉴定人接受司法机关的委托，从事委托请求事项的司法鉴定；非诉讼案件鉴定的受托从其行业规定；
2.受理，司法鉴定机构收到委托书后，应对委托人的委托事项进行审核；
3.初次鉴定，鉴定机构受理案件后，应当指派具有社会专业司法鉴定资格的人员承担鉴定工作，同一鉴定事项应当由两名具有社会专业司法鉴定资格的人员进行；
4.补充鉴定，司法鉴定机构接受委托进行补充鉴定，应当对委托人请求的事项进行审查；
5.重新鉴定，重新鉴定仍在原社会专业司法鉴定机构进行的，不能由原鉴定人承办重新鉴定的事项；
6.复核鉴定，对鉴定结论有异议需进行复核鉴定的，其他资质较高的司法鉴定机构可以接受委托，进行复核鉴定
7.司法鉴定文书的出具，司法鉴定人完成社会专业司法鉴定工作后，应当出具司法鉴定文书。
三、
机构伤残鉴定多少钱
机构伤残鉴定三百五十元左右，具体根据不同情形规定，每个地方标准不一样。各地收费标准不同，同一个地方不同的鉴定机构收费不同，同一家鉴定机构，不同的委托方式收费也不同，个人委托便宜，***委托费用高。
1.损伤程度鉴定：300-600/人；
2.交通事故伤残评定：300-600/人；
3.劳动能力、评残鉴定：400-800/人；
4.行为能力鉴定：800-1000/人；
5.活体年龄鉴定：400-800/人；
6.损伤与疾病关系鉴定：600-1000/人；
7.男性性功能鉴定：500-800/人；
8.医疗***司法鉴定件：2000-3000/人；
9.活体检验照相：50-80/人。