农村合作医疗新生儿住院报销比例最多是百分之六十，具体由门诊等级确定的，例如镇卫生院报销是百分之六十，二级医院报销百分之四十，三级医院报销是百分之三十。
一、
农村合作医疗新生儿住院报销比例是多少
农村合作医疗新生儿住院报销比例最多报销60%，详细报销比例如下：
1.镇卫生院报销60%；
2.二级医院报销40%；
3.三级医院报销30%。
新农合一般指新型农村合作医疗。
二、
农村合作医疗报销流程
找法网提醒您，农村合作医疗报销流程为：
1.如果是在市内定点医疗机构就诊，可以直接在窗口刷卡报销。
2.在市外2级及以上的公立医院就诊，需要在出院的3个月后携带就医资料以及身份证、户口簿前往区服务中心报销。
3.审核通过后，报销的费用会打到指定的银行账户中。此外，也可以把相关材料交给村（社区）合作医疗联络员，让医疗联络员帮忙报销。
三、
农村医疗保险报销范围
1.检查费用报销。包括：治疗、注射、输液、清创缝合、针灸火罐、Ｂ超、心电图、Ｘ线、化验、一次性输液器、注射器等相关费用。
2.药品费用报销。根据各地政策文件规定的药品。农村合作医疗住院的报销范围。
3.住院费用报销。包括：住院期间的药费、检查费、治疗费、手术费、化验费、住院费等相关可以报销的费用，特殊门诊可报医疗费。
4.特殊病种费用报销。包括：恶性肿瘤化疗、重症尿毒症透析治疗、组织器官移植后排异治疗、失代偿期肝硬化、再生障碍性贫血、精神病结核病、系统性红斑狼疮、儿童孤独症、精神病、血友病、苯丙酮放尿症（限10岁以内儿童）。
5.农村合作医疗大病的报销范围。符合各地相关政策的医保目录，规定的医保开支范围内的医疗费用。