公司合并后应由新公司妥善处理相关债务，公司合并程序的具体程序是董事会制订合并方案、签订公司的合并协议、编制资产负债表、合并决议的形成、通知债权人等。
一、
公司合并后应如何妥善处理相关债务
公司合并后债权债务均由新公司承继。公司合并包括吸收合并和新设合并。公司合并需要进行公告，并通知债权人申报债权，还应当登报。公司合并不需要清算。
《中华人民共和国公司法》第一百七十二条
【公司的合并】公司合并可以采取吸收合并或者新设合并。
一个公司吸收其他公司为吸收合并，被吸收的公司解散。两个以上公司合并设立一个新的公司为新设合并，合并各方解散。
二、
公司合并程序的具体程序是什么
找法网提醒您，公司合并程序的具体程序如下：
1.董事会制订合并方案；
2.签订公司的合并协议；
3.编制资产负债表和财产清单；
4.合并决议的形成；
5.向债权人通知和公告；
6.合并登记。
三、
公司合并的好处是什么
公司合并的好处是：合并方避免了巨大的融资压力和现金流出，不影响合并后企业的资金周转和经营；避免了敌意收购可能造成两败俱伤的风险；可以享受延迟纳税的税收优惠待遇；增强实力；扩大公司经营规模；增强市场占有率等。
《中华人民共和国公司法》第一百七十三条公司合并，应当由合并各方签订合并协议，并编制资产负债表及财产清单。公司应当自作出合并决议之日起十日内通知债权人，并于三十日内在报纸上公告。债权人自接到通知书之日起三十日内，未接到通知书的自公告之日起四十五日内，可以要求公司清偿债务或者提供相应的担保。
《中华人民共和国公司法》第一百七十四条公司合并时，合并各方的债权、债务，应当由合并后存续的公司或者新设的公司承继。