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律师解答：
确定股权转让协议管辖的方式是：一般属于被告住所地或者合同履行地人民法院。但是，当事人依法约定由原告住所地、标的物所在地等人民法院管辖的除外。实际上与争议有关，管辖权属于约定的法院。
法律依据
《中华人民共和国民事诉讼法》第二十四条因合同纠纷提起的诉讼，由被告住所地或者合同履行地人民法院管辖。
《中华人民共和国民事诉讼法》第三十四条本条规定的下列案件由人民法院专属管辖：
(一)因房地产纠纷提起的诉讼，由房地产所在地人民法院管辖；
(二)因港口经营纠纷提起的诉讼，由港口所在地人民法院管辖；
(三)因继承纠纷提起的诉讼，由被继承人死亡时住所地或者主要遗产所在地人民法院管辖。
《中华人民共和国民事诉讼法》第三十五条：合同或者其他财产权利纠纷的当事人，可以书面协议选择被告住所地、合同履行地、合同签订地、原告住所地、标的物所在地等与纠纷有实际关系的地点的人民法院，但不得违反本法关于分级管辖和专属管辖的规定。