进行发明专利实质审查的方式是申请日起三年内，向国务院专利行政部门提出申请或者国务院专利部门自行决定。实质审查的内容包括专利申请是否符合关于发明单一性的要求。
一、
如何进行发明专利实质审查
发明专利申请实质审查进行的方式：自申请日起三年内，国务院专利行政部门根据申请人随时提出的请求，或国务院专利行政部门自行决定，对其发明专利的新颖性、创造性、实用性等实质内容予以核实。若符合法定审查标准的，应当予以授权，并发给专利证书。
《中华人民共和国专利法》第三十六条
发明专利的申请人请求实质审查的时候，应当提交在申请日前与其发明有关的参考资料。
发明专利已经在外国提出过申请的，国务院专利行政部门可以要求申请人在指定期限内提交该国为审查其申请进行检索的资料或者审查结果的资料；无正当理由逾期不提交的，该申请即被视为撤回。
二、
实质审查的内容
实质审查审核以下的内容：
1.申请专利的主题是不是专利法及其实施细则意义下的发明，是否属于不能授予专利权的范围。
2.申请专利的主题是否违反国家法律、社会公德或者妨害公共利益。
3.专利申请是否符合关于发明单一性的要求。
4.如果申请人对申请提出了修改或者分案申请，是否超出了原说明书（包括附图）和权利要求书记载的范围。
5.在申请要求优先权的情况下，如果发现在优先权日和申请日之间其他人就同一主题提出了另外的专利申请，或者经过检索发现存在在此期间公开的相关对比文件，应当审查优先权要求是否成立。
6.根据检索出的对比文件判断发明专利申请所要求保护的技术方案是否具有新颖性和创造性，判断要求保护的发明是否具有实用性。
7.说明书是否已对发明专利申请所要求保护的发明作了清楚、完整的说明，使所属领域的技术人员能够实现。
8.权利要求是否清楚和简要地表述了请求保护的范围，权利要求是否以说明书为依据，独立权利要求是否包括了为解决发明所要解决的技术问题的必要技术特征。
三、
发明实质审查费多少
找法网提醒，发明实质审查费一般是2500元。专利局可以就某些费用（申请费、发明申请审查费、发明申请维持费、复审费和授权后三年的年费五项）对确有困难的申请人实行减缓。申请人为单位的，可减缓上述费用的70%（复审费减缓60%），申请人为个人的，可减缓上述费用的85%（复审费减缓80%）。实质审查是指国家知识产权局对发明专利申请的申请文件进行仔细研究，对要求保护的发明进行检索，确定该发明是否符合专利法及实施细则的规定，最终作出是否授予专利权的决定。